Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEURL4Q96JN8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NEURL4Q96JN8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NEURL4Q96JN8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms