Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK5RAP3Q96JB5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDK5RAP3Q96JB5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms