Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LTV1Q96GA3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LTV1Q96GA3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LTV1Q96GA3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms