Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SGTBQ96EQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGTBQ96EQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms