Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTP4Q96DX8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms