Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG4CQ96DT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG4CQ96DT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms