Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCTD12Q96CX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms