Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP7

TLCD1, Calfacilitin, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD1Q96CP7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TLCD1Q96CP7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLCD1Q96CP7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLCD1Q96CP7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms