Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYAP1Q96A49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYAP1Q96A49 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms