Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX21Q969T3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms