Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HLA-CQ95604 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-CQ95604 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-CQ95604 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms