Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHMTQ93088 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMTQ93088 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms