Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD50Q92878 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD50Q92878 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAD50Q92878 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms