Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC1Q92574 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSC1Q92574 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC1Q92574 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms