Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GATAD2BQ8WXI9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GATAD2BQ8WXI9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms