Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PHIPQ8WWQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHIPQ8WWQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHIPQ8WWQ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms