Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC12Q8WVT3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC12Q8WVT3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms