Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GIPC3Q8TF64 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GIPC3Q8TF64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms