Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SH3RF3Q8TEJ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3RF3Q8TEJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms