Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FAT3Q8TDW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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