Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGARPQ8TDB4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MGARPQ8TDB4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms