Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF398Q8TD17 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms