Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMO3Q8TAP4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMO3Q8TAP4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMO3Q8TAP4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms