Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PATJQ8NI35 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PATJQ8NI35 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms