Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFWD2Q8NHY2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms