Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC112Q8NEF3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC112Q8NEF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC112Q8NEF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC112Q8NEF3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC112Q8NEF3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC112Q8NEF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC112Q8NEF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms