Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACBD4Q8NC06 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACBD4Q8NC06 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms