Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TTC29Q8NA56 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC29Q8NA56 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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