Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMPERQ8N8U9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMPERQ8N8U9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BMPERQ8N8U9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BMPERQ8N8U9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMPERQ8N8U9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMPERQ8N8U9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms