Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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TMCO5AQ8N6Q1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TMCO5AQ8N6Q1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TMCO5AQ8N6Q1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMCO5AQ8N6Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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