Protein–RNA interactions for Protein: Q8N660

NBPF15, Neuroblastoma breakpoint family member 15, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF15Q8N660 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NBPF15Q8N660 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NBPF15Q8N660 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NBPF15Q8N660 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms