Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC24Q8N4L8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC24Q8N4L8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC24Q8N4L8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms