Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NME8Q8N427 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NME8Q8N427 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME8Q8N427 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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