Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PROM2Q8N271 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PROM2Q8N271 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PROM2Q8N271 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms