Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CMTR1Q8N1G2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CMTR1Q8N1G2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms