Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIRREL3Q8IZU9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIRREL3Q8IZU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms