Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLF2Q8IX21 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLF2Q8IX21 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms