Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC9A9Q8IVB4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC9A9Q8IVB4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms