Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PACS2Q86VP3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PACS2Q86VP3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACS2Q86VP3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms