Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMC4Q7Z404 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms