Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CATSPER4Q7RTX7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CATSPER4Q7RTX7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms