Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLRP9Q7RTR0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP9Q7RTR0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms