Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYFIP1Q7L576 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYFIP1Q7L576 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.6 ms