Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIAA0408Q6ZU52 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIAA0408Q6ZU52 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms