Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CFAP47Q6ZTR5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CFAP47Q6ZTR5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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