Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF493Q6ZR52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF493Q6ZR52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms