Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIG3Q6UXM1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms