Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL17Q6UXB2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL17Q6UXB2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms