Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCIMPQ6UWF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCIMPQ6UWF3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCIMPQ6UWF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms