Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EMBQ6PCB8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMBQ6PCB8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms